巴马瑶族自治县妇保院前身是巴马县妇保站，建于1956年，是一所爱婴医院和国家二级甲等妇幼保健院；承担全县妇女儿童的医疗、保健、健康教育、培训、妇幼卫生信息管理等任务，是全县妇幼保健及重大公共卫生妇幼项目技术指导中心；是全县婚前医学检查、医疗保险和新型农村合作医疗定点单位；本院拥有先进的计算机信息网络管理系统，诊疗全部实现信息化，为广大患者提供方便的服务。
现有职工166人，其中卫技人员137人，高级职称3人；中级职称30人，业务用房5342㎡；开放病床122张，另设有10张为临产孕妇提供免费住宿待产；病房环境舒适，内有开水、热水供应系统、卫生间、空调、电视等便民措施。该院医疗设备先进：拥有进口彩色B超、德国进口的听力筛查仪、麻醉机、十二导联日本光电心电图机、500mA X光机、早产儿培养箱、蓝光治疗仪、经皮黄疸测定仪、小儿心电监护仪、聚焦超声妇科治疗仪、电子阴道镜、腹腔镜、盆底功能康复治疗仪等。